Изобретение относится к области медицины. Осуществляют регистрацию движений глаз, измеряют межсаккадические интервалы (МСИ) и сравнивают их с таксонами МСИ, заданными из условия характеристик временных масштабов процессов психической регуляции на разных уровнях. Также регистрируют и измеряют длительности реакций активации кожно-гальванического рефлекса (РА КГР) и сравнивают их с упомянутыми таксонами МСИ. При этом дополнительно определяют Р-Р интервалы электрокардиограммы (СПИ ЭКГ), длительность которых меньше длительности предыдущего белее чем на величину, на которую различается длительность интервалов соответствующих воздействию парасимпатической системы, от интервалов, соответствующих воздействию симпатической нервной системы. Сравнивают их с таксонами МСИ, и оценку процессов регуляции деятельности осуществляют по данным МСИ, величины таксонов которых более величин таксонов РА КГР и СПИ ЭКГ, соответственно, а оценку процессов регуляции функциональных состояний по данным МСИ, величины таксонов которых совпадают с величинами таксонов РА КГР и СПИ ЭКГ, соответственно. Способ расширяет арсенал средств для оценки деятельности и функциональных состояний человека. 1 табл.